脂质关键词分析

天津中医药栽蚤葬灶躁蚤灶允燥怎则灶葬造燥枣栽则葬凿蚤贼蚤燥灶葬造悦澡蚤灶藻泽藻酝藻凿蚤糟蚤灶藻圆园15年2月第32卷第2期Feb援圆园15熏灾燥造援32晕燥援2图1脂质组学文献年度分布Fig.
1Thedistributionofpublicationyearsofliteratureonlipidomics篇年中国脂质组学研究现状的文献计量学分析*王泓午,赵紫薇,曹姗,周萱,徐芳,于春泉(天津中医药大学,天津300193)摘要:[目的]了解国内脂质组学研究现状.
[方法]收集中国2003年至今的脂质组学文献,并运用NoteEx原press3.
0、Bicomb2.
0和SPSS19.
0软件进行文献计量学分析.
[结果]共检出有效文献74篇.
脂质组学研究的年发文量呈上升趋势,基本形成核心作者群体,天津大学,中国科学院,北京协和医学院分别为发文量前三位的研究机构,通过对18个高频关键词的分析,得到5个热点主题方向.
[结论]国内脂质组学研究尚处于初始阶段,炎症相关的脂质组学研究有待进一步深入.
关键词:脂质组学;文献计量学;研究现状中图分类号:R589.
2文献标志码:A文章编号:1672-1519(2015)02-0076-04*基金项目:国家重点基础研究发展计划(怨苑猿计划)资助项目(圆园员源悦月缘源圆怨园圆).
作者简介:王泓午(1966-),男,医学博士,教授,博士生导师,主要从事中医证候学研究.
通讯作者:于春泉,E-mail:ycq-4@163.
com.
脂质是指一大类不溶于水而易溶于非极性有机溶剂且化学成分与结构非均一的有机化合物,参与生命活动,为生物提供能量,是生物膜的骨架成分[1].
2003年由美国圣路易斯华盛顿大学Han等[2]正式提出脂质组学这一概念,其属于代谢组学的重要分支,即对生物体内的脂类物质进行系统的分析,研究其相互作用以及与其他生物分子的作用.
脂质组学的提出兴起了对脂代谢调控在各种生物现象中作用机制研究的热点[3-5],广泛应用于生命、医药等学科领域之中.
现将2003年至今的国内有关脂质组学研究的文献进行收集整理,运用文献计量学的方法分析其研究现状,望为今后中医药脂质组学研究提供参考.
1资料来源与方法1.
1数据库来源以中国知网、维普中文科技期刊数据库、万方数据库为检索来源.
1.
2检索策略选择主题检索,检索自由词"脂质组学",检索时间限定为2003年1月—2014年10月.
1.
3纳入与排除标准同时符合如下条件:1)纳入以脂质组学为主题的文献,排除非该主题文献.
2)纳入文献的类型为会议论文,期刊文章、学位论文,排除新闻、会议通知、文摘、书籍等类型文献.
3)纳入的文献需有足够信息摘要且可获得全文,排除资料缺失、不能获取全文的文献.
4)排除重复文献.
1.
4研究方法将检出文献的题录导入NoteExpress3.
0软件,根据"年度""题目"字段进行查重,保留资料最完整的文献,并通过人工查阅全文的方式筛选符合纳入标准的文献.
运用NoteExpress3.
0、Bicomb2.
0和SPSS19.
0软件,对文献的年度分布、研究单位、核心作者群、关键词的共词聚类以及研究热点进行计量学分析,以了解脂质组学研究现状.
2结果检出文献数量分别为中国知网68篇,维普中文科技期刊数据库19篇,万方数据库110篇.
对检出文献进行清洗后,共纳入有效文献74篇,其中学位论文25篇,会议论文8篇,期刊文章41篇.
2.
1文献年度分析文献的年度分布情况,可以从一定程度上反映该领域的发展情况,分析文献量与时间变化的关系,可以大体揭示该学科的发展阶段与规律[6].
脂质组学文献最早的3篇文献发表于2004年,2004年至2008年平均年发文量不足5篇,2009年起年发文量逐年上升,2013年达到顶峰14篇,增长趋势见图1(注:2014年只收录了1月到10月间发DOI:10.
11656/j.
issn.
1672-1519.
2015.
02.
0476圆园15年2月第32卷第2期Feb援圆园15熏灾燥造援32晕燥援2天津中医药栽蚤葬灶躁蚤灶允燥怎则灶葬造燥枣栽则葬凿蚤贼蚤燥灶葬造悦澡蚤灶藻泽藻酝藻凿蚤糟蚤灶藻图2脂质组学文献共词聚类树状图Fig.
2Theclusteringtreegraphofhighfrequencykeywordoflipidomics表2脂质组学文献高频关键词频率分布表Tab.
2Thehighfrequencykeywordofliteratureonlipidomics序号关键字段出现频次累计百分比(豫)01脂质组学3208.
4202质谱1011.
0503代谢组学1013.
6804磷脂0715.
5305电喷雾电离串联质谱0416.
5706脂蛋白0417.
6307脂肪肝0418.
6808动脉粥样硬化0419.
7409血清0420.
7910调脂0321.
5811液相色谱-质谱0322.
3712胆固醇酯0323.
1613超高效液相色谱/飞行时间质谱联用技术0323.
9414炎症0324.
7415冠心病0325.
5216域型糖尿病0326.
3217红豆杉细胞0327.
1118高脂血症0327.
89表的文献),表明脂质组学这一新兴学科正逐渐被研究者们所关注.
2.
2研究机构分布共有49个研究机构发表脂质组学文献,其中大学院校参与发表44篇,医院发表23篇,研究所发表20篇.
发文量前3名的研究机构分别为天津大学9篇(12.
16%)、中国科学院6篇(8.
11%)、北京协和医学院6篇(8.
11%).
74篇有效文献中由研究机构独立发表39篇(52.
70%),多机构合作发表35篇(47.
30%),发文量前10位的研究机构如表1所示.
2.
3高频关键词分析关键词的共词聚类分析可以反映某一学科的研究热点[7],其主要原理是对一组词两两统计它们在同一篇文献中出现的次数,以此为基础对这些词进行聚类分析,从而反映出这些词之间的亲疏关系,进而分析这些词所代表的学科或主题的结构与变化[8].
运用Bicomb2.
0软件提取全部文献的关键词,对相同意义词语(如"非酒精性脂肪性肝病"同"NAFLD"、"超高效液相色谱/四级杆飞行时间质谱仪同"UPLC-Q/TOFMS")进行清洗后获得关键词380个,截取频次3次及以上为高频关键词(见表2),生成共词矩阵,应用SPSS19.
0对其进行聚类分析,得到共词聚类树状图.
见图2.
2.
4核心作者分析共有225位作者参与发表脂质组学文献的发表.
其中发表文献3篇的1人,2篇23人.
根据普莱斯定律[9],核心作者所发表的文献应占文献总量的50%,核心作者最低文献量(皂)为:m=0.
749nmax姨,其中n指文献量最多的作者的文献数[10].
在本文中nmax=3,根据公式得m=1.
30,需取整数为2篇,发文量为2篇及2篇以上的作者共24人(详见表3),占全部作者的10.
67%,这些作者共发表文献49篇,占文献总量的66.
22%,符合普莱斯定律的要求,即脂质组学研究已基本形成核心作者群.
3讨论3.
1磷脂的色谱分析及质谱检测方法(基于关键字段1、2、4、17、7、5、11)陆姝欢[11]建立了以液质联表1脂质组学研究机构分布情况Tab.
1Thedistributionofinstitutionsonlipidomicsresearch研究机构发文量(篇)占百分比(%)天津大学912.
16中国科学院608.
11北京协和医学院608.
11上海交通大学405.
41中南大学304.
05北京大学304.
05南京军区南京总医院304.
05广东药学院304.
05浙江大学304.
05浙江工商大学304.
0577天津中医药栽蚤葬灶躁蚤灶允燥怎则灶葬造燥枣栽则葬凿蚤贼蚤燥灶葬造悦澡蚤灶藻泽藻酝藻凿蚤糟蚤灶藻圆园15年2月第32卷第2期Feb援圆园15熏灾燥造援32晕燥援2表3脂质组学核心作者发文量Tab.
3Thedistributionofliteraturequantityfromcoreauthor姓名发文量(篇)单位姓名发文量(篇)单位汪俊军3南京军区南京总医梅旭荣2中国农业科学院习聪2北京协和医学院药物研究所欧阳丽娜2中南大学药学院再帕尔·阿不力孜2北京协和医学院药物研究所厉有名2浙江大学医学院附属第一医院殷婷婷2沈阳药科大学药学院王友谊2浙江工商大学向大位2中南大学药学院王涛2中国农学院向大雄2中南大学药学院肖新华2北京协和医院张春妮2南京总医院全军医学检验中心贺玖明2北京协和医学院药物研究所吴雪2中南大学药学院赵丽丽2广东药学院张瑞萍2北京协和医学院药物研究所陈艳华2北京协和医学院药物研究所李平2中日友好医院钟秀丽2中国农业科学院龚友兰2中南大学药学院陆姝欢2天津大学化工学院杨松2天津大学化工学院赵铁2中日友好医院用技术(HPLC/ESI/MSn)为基础的高通量、高灵敏度及高分辨率的研究方法,为红豆杉细胞包含的6类84种磷脂分子建立了磷脂图库.
王友谊[12]基于鸟枪法的脂质组学研究策略,分别建立了直接进样电喷雾串联质谱法分析磷脂和流动注射电喷雾串联质谱法分析胆固醇酯的方法,并应用这两种方法分析了生物样本中磷脂和胆固醇酯的分子种和含量.
刘莹[13]采用液质联用技术对酿酒酵母细胞磷脂和固醇进行定性定量研究,从脂质组学角度系统分析酿酒酵母细胞在在不同乙醇浓度下二倍体和单倍体发酵体系的脂代谢的变化规律和脂生物标志物,从脂组学角度揭示细胞应对不同浓度乙醇刺激的响应应答机制.
3.
2高脂血症在动脉粥样硬化与冠心病中的作用机制(关键字段8、18、10、6、12、15)汪俊军等[14]通过对血液样本的检测得出高脂血症人群血清氧化型低密度脂蛋白水平升高,与低密度脂蛋白中甘油三酯/胆固醇比值高度呈正相关.
高脂血症人群胆固醇酯转运蛋白水平升高,促进了脂蛋白间脂质转运,使高密度脂蛋白和低密度脂蛋白脂质组成发生变化,促进了动脉粥样硬化的发生和发展.
3.
3域型糖尿病的脂质组学分析(关键字段9、16、3、13)陶旭光等[5]采集域型糖尿病大鼠血清,运用高效液相色谱串联四极杆飞行时间质谱法(HPLC-Q/TOF-MC)进行脂质学分析,结果表明,相对于正常大鼠,甘油脂类、鞘脂类、磷酯酰丝氨酸、孕烯醇酮脂水平明显升高,糖脂水平显著下调,存在多途径的脂代谢紊乱,并且结果显示复方中药人参白虎汤及六味地黄丸较单一化合物的西药二甲双胍具有更好调节脂质紊乱的作用.
3.
4炎症的脂质组学研究(关键字段14)赵丽丽[15]运用超高效液相色谱/四级杆飞行时间质谱仪(UPLC-Q/TOFMS)分析RAW264.
7细胞中的甘油磷脂类代谢物鉴别了RAW264.
7细胞中的78个甘油磷脂类成分,有22个磷脂酰乙醇胺、49个磷脂酰胆碱、4个磷脂酰甘油、1个磷脂酰肌醇和2个未知的甘油磷脂类成分,并发现磷脂酰胆碱PC(16颐0/18颐1)和磷脂酰乙醇胺PE(18颐0/18颐1)的代谢调节贯穿于炎症的发生和消退过程,可能是炎症发生、消退过程中的重要的脂质标记物.
3.
5其他目前脂质组学在脂质代谢疾病的预防、控制及诊断、脂质生物标志物、药物靶点的鉴定以及药物的研发等方面取得了重要进展[16-18].
殷婷婷等[19]采用超高效液相色谱飞行时间质谱连用技术,探讨风湿性疾病湿热证的脂质组学特征,通过强直性脊柱炎湿热证组与非湿热证组血清脂质指纹图谱的比较显示,部分甘油磷脂酰胆碱类和甘油三酯类为强直性脊柱炎湿热证脂质代谢的特异性本质;通过强直性脊柱炎、同性性关节炎湿热证组与健康人对照组的比较,提示溶血甘油磷脂酰胆碱类Lyso-GPC(16颐0)Lyso-GPC(18颐2)与Lyso-GPC(18颐1)可能是风湿性疾病湿热证脂质代谢的共性实质.
赵铁等[20]认为柴黄益肾颗粒干预可以延缓糖尿病肾病大鼠的病程进展,其机制可能与该颗粒对脂质特别是鞘脂类代谢异常的调节功能有关.
研究方法是运用超高压液相-四级杆飞行时间质谱联用技术,比78圆园15年2月第32卷第2期Feb援圆园15熏灾燥造援32晕燥援2天津中医药栽蚤葬灶躁蚤灶允燥怎则灶葬造燥枣栽则葬凿蚤贼蚤燥灶葬造悦澡蚤灶藻泽藻酝藻凿蚤糟蚤灶藻ThebibliometricmanalysisoflipidomicsresearchinChinaWANGHong鄄wu袁ZHAOZi鄄wei袁CAOShan袁ZHOUXuan袁XUFang袁YUChun鄄quan渊TianjinUniversityofTraditionalChineseMedicine,Tianjin300193,China冤Abstract:[Objective]Literaturedomesticlipidomicswereanalyzedtounderstandthestatusofresearchlipidomics.
[Methods]Wecol鄄lectedsince2003lipidomicsliterature,andusedNoteExpress3.
0,Bicomb2.
0andSPSS19.
0softwareforbibliometricanalysis.
[Results]Atotalof74validdocumentswerescreenedout.
Theamountofliteraturepublishedwereontherise.
ThetopthreeinstitutionswereTianjinUniversity,ChineseAcademyofSciencesandChineseAcademyofMedicalSciencesBeijingUnionMedicalCollege.
Throughtheanalysisof18high鄄frequencykeywordswegot5hottopics.
[Conclusion]Domesticlipidomicsresearchisstillinitsinitialstage.
Inflam鄄mationlipidomicsresearchneedstobefurtherdeepened.
Keywords院lipidomics;bibliometric;currentresearchsituation较脂质代谢物在干预前后的变化,结果显示4种鞘磷脂酰胆碱杂酝(悦猿猿颐员)、杂酝(凿员愿颐员/员远颐员)、杂酝(悦源圆颐猿)、杂酝(悦源圆颐圆)与圆种甘油磷脂酰胆碱孕悦(源圆颐员园)、孕悦(36颐4)改善明显,相对变化倍数分别为1.
50、1.
38、1.
23、1.
29、1.
15与1.
30.
综上所述,本文通过搜集脂质组学研究文献,运用文献计量学的方法分析其研究现状.
脂质组学作为一门新型学科,国内研究尚属初级阶段.
从近5年研究热度来看,炎症方向的脂质组学研究文献相对较少,提示此方向可能成为日后研究的新热点,为临床医生以及研究人员对脂质组学进一步的深入研究提供参考.
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(收稿日期:2014-11-03)(本文编辑:李琳,高杉)79