blastp,blastp

blastp如何查找一个基因在毛果杨中的CDS、蛋白质和基因组序列?
2021-08-02

请教BLAST分析的含义和操作BLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。BLAST结果中的得分是对一种对相似性的计说明。BLAST对一条或多条序列(可以是任何形式的序列)在一个或多个核酸或蛋白序列库中进行比对。BLAST还能发现具有缺口的能比对上的序列。BLAST是基于Altschul等人在J....

blastpncbi blastp怎么设库
2021-08-02

BLAST套件的blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx子工具的用途什么?BLAST套件的blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx子工具的用途分别如下: 1、blastn是将给定的核酸序列与核酸数据库中的序列进行比较。 2、blastp是使用蛋白质序列与蛋白质数据库中的序列进行比较,可以寻找较远的关系。 3、blastx则是将给定的核酸序列按照六种阅读框架将其翻译成蛋白质与...

blastpBLAST有什么用?为什么要BLAST?
2021-08-02

blast+怎么用蛋白序列比对核苷酸序列不太明白你想问什么。用vector NTI等软件可以对两个序列进行序列比对,给出的positive值就可以看出同源度了。 若同时拿家族中3个序列进行比对,就可以得到进化树,更直观一点。blastx是什么?blast全称是Basic Local Alignment Search Tool,是一种基于序列比对而判断核酸或蛋白的算法。当你获得了一段DNA序列(或者mRNA序列、蛋白序列等),却不知道它属...

blastpblast是什么意思
2021-08-02

为什么Blast比对出的是RNA不是DNA不知道你是在什么数据库中比对的,但是一般数据库都会选择比对方式,BLASTN是比对核苷酸、BLASTP是比对蛋白 TBLASTN是蛋白(或者核苷酸)比对核苷酸等等,一般是看BLAST后选择的信息输出方式是核苷酸(RNA/DNA)还是蛋白,如果在NCBI这种通用数据库中一般输出的是基因组DNA信息或者是mRNA对应的cDNA信息用一个蛋白质序列blastp和对应的cds序列blastn结果有什么异...

blastpblast 和bomb的区别
2021-08-02

怎么进行BLAST对于Windows用户,根据自己的机器下载32位或者64位的安装包,下载完成之后按照常规软件安装步骤安装即可。 对于Linux用户,如果是Fedora或者Suse版本的操作系统,可以选择已经编译好RPM包,然后使用yum localinstall ***.rpm命令安装,不过需要root超级用户权限。不过,为了安装的简洁性,对于所有的Linux系统(无论那个版本),还是建议下载已经编译好的可执行文件包,如ncbi-bl...