如何查看一个lncrna功能lncRNA其实也是基因的一种转录本,所以你可以到那些RNA相关的大数据库比如ncbi,hgnc等。你也可以到那些专一收集整理lncRNA的数据库比如lncRNAdb 这些数据库中去查询。。肯定能找得到。。转录组测出来的lncrna怎么预测其功能全转录组是指特定细胞在特定状态下所能转录出来的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA(non-coding RNA)。针对非编码RNA的研究主要集中在具有调控作...
如何用RT-PCR的方法以获得全长LncRNA相应的cDNAYou may need to examine levels of these two lncRNAs transcription in different cell lines or tissues before RT-PCR. The other issue is that you could try to screening cDNA libraries to fish ...
如何利用生物信息学筛选目的lncrna给你一个大致的筛选标准: (1)选择长度≥200bp,Exon个数≥2的转录本; (2)通过计算每条转录本的Reads覆盖度,选择Reads最小覆盖 度≥3的转录本; (3)去除已知的mRNA转录本(通过和已有注释文件比对) (4)去除已知的非编码RNA转录本(比对一些已有的lncRNA数据库了) (5)去除有蛋白家族的转录本(能够注释到Pfam数据库); (6)去除有编码潜能的RNA(CNCI,C...